Dari tahun 1985 hingga 1990. Beliau juga pernah menjadi Ketua Jam’iyah Thariqah NU.
Selain itu ia juga aktif organisasi partai. Seperti menjadi Ketua MPP Partai Persatuan Pembangunan dari tahun 1995 hingga 1999. kemudian menjadi Ketua Majelis Syari’ah PPP sejak 2004.
Putra Putri KH Maimun Zubair
Dalam biografi KH Maimun Zubair (Mbah Moen) di ketahui bahwa ia menikah dengan nyai Hj Fatimah yang merupakan anak dari KH Baidhowi Lasem.
Istrinya Hj Fatimah meninggal dunia pada tanggal 18 Oktober 2011.Dari pernikahannya ini, ia di karuniai tujuh orang anak.
Namun empat di antaranya meninggal ketika masih kecil. sedangkan tiga orang anaknya yang lain di ketahui bernama KH Abdullah Ubab, KH Muhammad Najih dan Neng Shobihah.
KH Maimun Zubair (Mbah Moen) juga di ketahui menikah dengan wanita bernama Nyai Masthi’ah, anak dari KH Idris asal Cepu.
