Struktur subkortikal adalah kelompok struktur saraf yang tertanam jauh di dalam otak. Struktur ini meliputi diensefalon, ganglia basal, sistem limbik, dan kelenjar pituitari.
Diencephalon terletak jauh di dalam materi putih otak. Ini adalah kumpulan dari empat struktur otak yang terletak di setiap sisi garis tengah, secara bilateral ke ventrikel ketiga otak. Ini termasuk:
Thalamus , yang merupakan massa inti berbentuk oval yang terdiri dari empat kelompok inti: inti anterior, medial, lateral, dan intralaminaris thalamus.
Thalamus menyampaikan informasi sensorik dan motorik ke dan dari korteks serebral.
Epithalamus , yang merupakan bagian paling posterior dari diencephalon. Terdiri dari badan pineal , stria medullaris, dan trigonum habenular.
Epithalamus terlibat dalam pengendalian siklus tidur-bangun (ritme sirkadian) dan inisiasi serta pengendalian gerakan.
